Este estudo buscou identificar dimensões latentes (não observáveis) que representam comportamentos específicos relacionados à atividade física e explorar seus efeitos potenciais no impacto da obesidade e na distribuição espacial na Colômbia. Um estudo transversal (n = 9.658) foi realizado com base na Pesquisa Nacional da Situação Nutricional da Colômbia. A modelagem com equações estruturais generalizadas proposta combinou modelos de exposição e medição para definir um modelo de doença. A modelagem identificou dimensões latentes da atividade física com foco no tempo de tela e nos meios de transporte e estimou seus efeitos diretos e indiretos na ocorrência de obesidade. Técnicas de mapeamento foram utilizadas para ilustrar a adesão a essas dimensões. As dimensões latentes identificadas foram denominadas “Uso de telas” e “Transporte ativo”; esta última foi inversamente associada à ocorrência de obesidade (p = 0,004), sendo o uso de bicicletas em detrimento do de veículos automotores a variável dominante. O mapeamento mostrou que os departamentos com maior adesão ao construto “Transporte ativo” apresentam menor prevalência de obesidade. O uso da bicicleta em detrimento do transporte inativo configurou uma dimensão de comportamentos relacionados à atividade física com efeito protetor contra a obesidade. Isso sugere que o transporte ativo pode ser um fator importante a ser considerado no planejamento de intervenções preventivas. Além disso, as desigualdades sociais podem estar impulsionando a epidemia de obesidade e os comportamentos de atividade física na Colômbia, o que exige respostas equitativas e multissetoriais.