Introdução: Este trabalho relata a experiência do curso de “Desenvolvimento e produção de vacinas”, promovido pela Fiocruz, no âmbito das reuniões de Ministros da Saúde do Mercosul. A experiência foi desenvolvida no segundo semestre de 2023, com a participação de discentes da Argentina, Brasil, Paraguai e Uruguai como estados-membros do bloco e do Chile como Estado-Associado. Objetivo: Apoiar a hipótese de que só conseguiremos avançar na soberania sanitária no campo das vacinas se simultaneamente implantarmos a soberania em termos de estratégia e processo de formação de recursos humanos, articulando as capacidades da região em rede. Método: Trata-se de um relato que apresenta reflexões sobre a soberania em saúde na produção de produtos biológicos a partir de uma experiência de formação que envolveu a mobilização de capacidades existentes na Fiocruz, no Instituto Butantan e Nortec, a partir de aulas remotas síncronas e visitas técnicas presenciais. Resultados: Foram apresentados detalhes desta experiência, ao mesmo tempo que, a partir dela, buscamos traçar estratégias adequadas para a qualificação profissional continuada na região, com a finalidade de atingir a soberania sanitária em termos de produção regional de vacinas com vista à autossuficiência. Conclusões: Apesar das barreiras linguísticas e das diferenças institucionais entre o bloco e os países associados, a avaliação realizada ao final do curso confirma a pertinência e a necessidade de ampliarmos experiências como a desenvolvida. Fica evidente a necessidade de criar capacidades na região para alcançar efetivamente a soberania sanitária, bem como, a importância de incorporar alguns temas estratégicos identificados pelos discentes para dar continuidade à qualificação dos profissionais da região, em um processo de formação contínuo e permanente.